發票交叉稽核子係統是一套對增值稅專用發票、公路內河運輸發票、機動（dòng）車銷售統（tǒng）一發票的記賬聯和抵（dǐ）扣聯比對的（de）稅務係統，該係統是“金稅工程”的重要組成部分。
發票（piào）交叉稽核子係統的（de）原理是將購貨方所取得的抵扣聯（lián）和銷貨方（fāng）的存根聯的主要（yào）內容錄入計算機交叉稽核係統（tǒng），係統將自動在全國範（fàn）圍（wéi）內對每一筆經濟業務的抵扣聯和存根聯進行查找配（pèi）對，檢查出（chū）隻有抵扣聯而沒（méi）有存根聯（lián），或隻有存根聯而沒有抵扣聯，以及抵扣聯與存（cún）根聯內容不相符的增（zēng）值稅專用（yòng）發票，然後對這些增值稅專用發票進行檢查核實，實現對利用增值（zhí）稅（shuì）專用發票進行偷稅、騙稅等違法犯罪活動的（de）控製。
