總稅務司署是晚清管理全國海關關稅及（jí）海關行政事務的機構，其（qí）名義上隸屬（shǔ）於（yú）總理衙門或外務部。總稅務司署（shǔ）設總稅務司一（yī）人（rén），掌（zhǎng）握全國海（hǎi）關關（guān）稅、行政（zhèng）及關員任免等事務，後添設副總稅務（wù）司一人協助之，於宣統二年撤去。
稅務司（sī）署下設五科三處，即負責本署及各海關事務的總務科，負責機要文件的機要科，總轄海關會議兼管債務、賠款並審查各海關（guān）會議事務的統計科，負（fù）責各關漢文報告及總稅務司署與政府（fǔ）各部門往來公文的漢文科，負責海關官員任免事務的銓敘科；設於上海負責編（biān）製、印刷、統計及（jí）供（gòng）應紙張（zhāng）、賬冊的造冊處，設於倫敦負責采辦海關用品、招用人員、接洽償還各國借款（kuǎn）的駐外辦事（shì）處，設於京師專門負責政府委辦的內債（zhài）基金事宜的內債基金處。
